Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC62Q6P9F0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC62Q6P9F0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms