Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
U2surpQ6NV83 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2surpQ6NV83 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms