Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScapQ6GQT6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScapQ6GQT6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms