Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg9aQ68FE2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg9aQ68FE2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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