Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp9cQ66X01 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp9cQ66X01 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms