Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CbarpQ66L44 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CbarpQ66L44 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms