Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc1Q5NCF2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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