Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam228bQ497Q6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam228bQ497Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam228bQ497Q6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms