Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 GCD2YGR083C 1956 nt2.61□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 YNL011CYNL011C 1335 nt2.61□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 EXO84YBR102C 2262 nt2.61□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 SLP1YOR154W 1764 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 MET5YJR137C 4329 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 AI3Q0060 1248 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 MRPL9YGR220C 810 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 GPI14YJR013W 1212 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 NNF1YJR112W 606 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 YKL131WYKL131W 522 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 TDA8YAL064C-A 381 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 NDL1YLR254C 570 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 PRM6YML047C 1059 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 ATP11YNL315C 957 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 ATG19YOL082W 1248 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 UFE1YOR075W 1041 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 UBS1YBR165W 834 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 AXL1YPR122W 3627 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 BI3Q0115 1554 nt2.6□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 SEC7YDR170C 6030 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 IKI3YLR384C 4050 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 SKT5YBL061C 2091 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 YDR209CYDR209C 414 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 PEX14YGL153W 1026 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 RPL27AYHR010W 411 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 PSF2YJL072C 642 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 RPS22AYJL190C 393 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 CCE1YKL011C 1062 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 RPL6BYLR448W 531 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 PRE8YML092C 753 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 MRPL17YNL252C 846 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 PDR17YNL264C 1053 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 MSN1YOL116W 1149 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 VAM3YOR106W 852 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 TYE7YOR344C 876 nt2.59□□□□□ -1.99
RRP42Q12277 GIN4YDR507C 3429 nt2.59□□□□□ -2
RRP42Q12277 VAC8YEL013W 1737 nt2.59□□□□□ -2
RRP42Q12277 PSK1YAL017W 4071 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 CDC55YGL190C 1581 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 PNC1YGL037C 651 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGR160WYGR160W 612 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 YHR022CYHR022C 771 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 YKL070WYKL070W 510 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 DLT1YMR126C 1029 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 RPL20AYMR242C 519 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 TSR4YOL022C 1227 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 snR44snR44 211 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 MPS1YDL028C 2295 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 PEX5YDR244W 1839 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 AVT5YBL089W 1380 nt2.58□□□□□ -2
RRP42Q12277 UBC9YDL064W 474 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 RPL13AYDL082W 600 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 FIN1YDR130C 876 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGL218WYGL218W 651 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 RPL14BYHL001W 417 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 LSM12YHR121W 564 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YER138CYER138C 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YER160CYER160C 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YJR027WYJR027W 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YML039WYML039W 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YML045WYML045W 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YMR050CYMR050C 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 NET1YJL076W 3570 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 NAB3YPL190C 2409 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 CWH41YGL027C 2502 nt2.57□□□□□ -2
RRP42Q12277 CDC20YGL116W 1833 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 YDL032WYDL032W 312 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 YNL203CYNL203C 612 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 AFT2YPL202C 1251 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 SWD3YBR175W 948 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 HBT1YDL223C 3141 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 ART10YLR392C 1557 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 ESC1YMR219W 4977 nt2.56□□□□□ -2
RRP42Q12277 PFF1YBR074W 2931 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 snR68snR68 136 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 STN1YDR082W 1485 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 TRM82YDR165W 1335 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 DPP1YDR284C 870 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 YGL117WYGL117W 798 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 RNR2YJL026W 1200 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 YIP3YNL044W 531 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 TPT1YOL102C 693 nt2.55□□□□□ -2
RRP42Q12277 GCY1YOR120W 939 nt2.55□□□□□ -2
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