Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MitfQ08874 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms