Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah2Q06986 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah2Q06986 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siah2Q06986 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siah2Q06986 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siah2Q06986 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Siah2Q06986 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah2Q06986 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah2Q06986 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah2Q06986 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms