Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	MET10	YFR030W	3108 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	MET5	YJR137C	4329 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	snR68	snR68	136 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RMD6	YEL072W	696 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	THO1	YER063W	657 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YGR115C	YGR115C	780 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	DOG2	YHR043C	741 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	GTT2	YLL060C	702 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	BRX1	YOL077C	876 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YPR203W	YPR203W	309 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CST9	YLR394W	1449 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SRP1	YNL189W	1629 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SRB8	YCR081W	4284 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YDR042C	YDR042C	603 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CDC40	YDR364C	1368 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YDR381C-A	YDR381C-A	345 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YFH7	YFR007W	1062 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YGL109W	YGL109W	324 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	PHO81	YGR233C	3537 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RCN1	YKL159C	636 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SKT5	YBL061C	2091 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	LTP1	YPR073C	486 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.06	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	VPS17	YOR132W	1656 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CDC37	YDR168W	1521 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	NOP56	YLR197W	1515 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ADY4	YLR227C	1482 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	MRS2	YOR334W	1413 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	FKH2	YNL068C	2589 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YJR020W	YJR020W	333 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CPR7	YJR032W	1182 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YOR152C	YOR152C	771 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YOR387C	YOR387C	621 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	TOM70	YNL121C	1854 nt		3.05	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	UBP14	YBR058C	2346 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CIN1	YOR349W	3045 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ESL1	YIL151C	3357 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	NSE4	YDL105W	1209 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	TAD1	YGL243W	1203 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	AIM18	YHR198C	966 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RNR2	YJL026W	1200 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ATG10	YLL042C	504 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ATP11	YNL315C	957 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	MDM36	YPR083W	1740 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SPP382	YLR424W	2127 nt		3.04	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	AGE1	YDR524C	1449 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SWC4	YGR002C	1431 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RIM1	YCR028C-A	408 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	UBC5	YDR059C	447 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YAR069C	YAR069C	294 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ERG29	YMR134W	714 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YOL114C	YOL114C	609 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	GCY1	YOR120W	939 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YBR063C	YBR063C	1215 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RRP15	YPR143W	753 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	snR35	snR35	204 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	MSH2	YOL090W	2895 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SOK1	YDR006C	2706 nt		3.03	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.03	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	JSN1	YJR091C	3276 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	FIN1	YDR130C	876 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YJL147C	YJL147C	1149 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	HHF2	YNL030W	312 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YNR025C	YNR025C	360 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RSM19	YNR037C	276 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	INO4	YOL108C	456 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	ARL3	YPL051W	597 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	SAP1	YER047C	2694 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	POL4	YCR014C	1749 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	AKR1	YDR264C	2295 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	FLO11	YIR019C	4104 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	MRH1	YDR033W	963 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	RAV2	YDR202C	1056 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	DIG2	YDR480W	972 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	LOC1	YFR001W	615 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	PNC1	YGL037C	651 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DSL1	P53847	YGL039W	YGL039W	1047 nt		3.01	□□□□□ -1.93

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