Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL3P36405 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL3P36405 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL3P36405 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL3P36405 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL3P36405 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL3P36405 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL3P36405 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL3P36405 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARL3P36405 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms