Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.1 ms