Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTNP21246 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTNP21246 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTNP21246 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTNP21246 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTNP21246 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTNP21246 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms