Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lama1P19137 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lama1P19137 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lama1P19137 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lama1P19137 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lama1P19137 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lama1P19137 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Lama1P19137 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lama1P19137 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lama1P19137 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lama1P19137 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lama1P19137 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms