Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoP15409 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RhoP15409 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RhoP15409 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RhoP15409 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RhoP15409 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoP15409 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RhoP15409 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RhoP15409 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms