Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NclP09405 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NclP09405 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NclP09405 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NclP09405 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NclP09405 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NclP09405 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NclP09405 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NclP09405 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NclP09405 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NclP09405 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms