Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb3P09026 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb3P09026 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms