Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM4AO75164 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4AO75164 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms