Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vamp4O70480 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vamp4O70480 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 433.4 ms