Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gp1baO35930 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1baO35930 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms