Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chil3O35744 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms