Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf5O35326 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf5O35326 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf5O35326 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms