Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad7O35253 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms