Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Speer4aF8VPX6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4aF8VPX6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms