Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox13F6YCR7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox13F6YCR7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms