Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20425E9Q035 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20425E9Q035 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20425E9Q035 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms