Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trappc8E9PWG2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trappc8E9PWG2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trappc8E9PWG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms