Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4933424G06RikA0A140LIP3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms