Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQK5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQK5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U3KQK5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U3KQK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
U3KQK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQK5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQK5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U3KQK5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQK5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
U3KQK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
U3KQK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQK5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
U3KQK5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
U3KQK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
U3KQK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQK5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQK5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
U3KQK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
U3KQK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
U3KQK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQK5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
U3KQK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
U3KQK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQK5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
U3KQK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
U3KQK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
U3KQK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
U3KQK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
U3KQK5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
U3KQK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
U3KQK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U3KQK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
U3KQK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
U3KQK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U3KQK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
U3KQK5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
U3KQK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
U3KQK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
U3KQK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
U3KQK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U3KQK5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U3KQK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
U3KQK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
U3KQK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
U3KQK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
U3KQK5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
U3KQK5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
U3KQK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
U3KQK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
U3KQK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
U3KQK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
U3KQK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
U3KQK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
U3KQK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
U3KQK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
U3KQK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
U3KQK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
U3KQK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U3KQK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U3KQK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
U3KQK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms