Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp5Q9Z2P8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vamp5Q9Z2P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vamp5Q9Z2P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vamp5Q9Z2P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vamp5Q9Z2P8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms