Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdpk1Q9Z2A0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdpk1Q9Z2A0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdpk1Q9Z2A0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdpk1Q9Z2A0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdpk1Q9Z2A0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdpk1Q9Z2A0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdpk1Q9Z2A0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms