Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sumo3Q9Z172 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sumo3Q9Z172 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sumo3Q9Z172 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sumo3Q9Z172 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sumo3Q9Z172 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sumo3Q9Z172 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sumo3Q9Z172 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms