Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ror1Q9Z139 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ror1Q9Z139 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ror1Q9Z139 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ror1Q9Z139 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ror1Q9Z139 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ror1Q9Z139 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ror1Q9Z139 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ror1Q9Z139 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ror1Q9Z139 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ror1Q9Z139 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms