Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn3Q9Z0Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dctn3Q9Z0Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dctn3Q9Z0Y1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dctn3Q9Z0Y1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dctn3Q9Z0Y1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dctn3Q9Z0Y1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms