Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAPN6Q9Y6Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN6Q9Y6Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAPN6Q9Y6Q1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN6Q9Y6Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN6Q9Y6Q1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms