Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARFGEF2Q9Y6D5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARFGEF2Q9Y6D5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARFGEF2Q9Y6D5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms