Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Z7

HCFC2, Host cell factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC2Q9Y5Z7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HCFC2Q9Y5Z7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HCFC2Q9Y5Z7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HCFC2Q9Y5Z7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HCFC2Q9Y5Z7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HCFC2Q9Y5Z7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HCFC2Q9Y5Z7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HCFC2Q9Y5Z7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms