Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX5Q9Y5X3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX5Q9Y5X3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX5Q9Y5X3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX5Q9Y5X3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX5Q9Y5X3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX5Q9Y5X3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX5Q9Y5X3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms