Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FARP1Q9Y4F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FARP1Q9Y4F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FARP1Q9Y4F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FARP1Q9Y4F1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FARP1Q9Y4F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP1Q9Y4F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms