Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP15Q9Y4E8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP15Q9Y4E8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP15Q9Y4E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP15Q9Y4E8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP15Q9Y4E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP15Q9Y4E8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP15Q9Y4E8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP15Q9Y4E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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