Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NR2E1Q9Y466 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NR2E1Q9Y466 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NR2E1Q9Y466 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NR2E1Q9Y466 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NR2E1Q9Y466 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR2E1Q9Y466 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR2E1Q9Y466 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E1Q9Y466 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR2E1Q9Y466 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms