Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT52Q9Y366 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT52Q9Y366 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT52Q9Y366 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT52Q9Y366 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT52Q9Y366 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFT52Q9Y366 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFT52Q9Y366 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms