Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNX24Q9Y343 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX24Q9Y343 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX24Q9Y343 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX24Q9Y343 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX24Q9Y343 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX24Q9Y343 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX24Q9Y343 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX24Q9Y343 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms