Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-209ENST00000479508 741 ntTSL 222.76■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-203ENST00000381117 798 ntTSL 1 (best)22.76■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-216ENST00000498313 988 ntTSL 522.36■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-215ENST00000493948 641 ntTSL 321.4■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-202ENST00000339046 1202 ntTSL 219.93■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-206ENST00000446063 1262 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 516.91■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 TSPAN32-208ENST00000461200 3325 ntTSL 216.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 37.6
DDX52Q9Y2R4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.952e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 220.76■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 518.45■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 217.41■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 411.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 215.34■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 37.5
DDX52Q9Y2R4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.422e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 429.82■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-222ENST00000513800 949 ntTSL 229.82■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 229.82■■■□□ 2.362e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.322e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-205ENST00000502930 548 ntTSL 428.94■■■□□ 2.222e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.172e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 227.31■■□□□ 1.962e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.51■■□□□ 1.832e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-206ENST00000504113 594 ntTSL 426.34■■□□□ 1.812e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-209ENST00000505403 645 ntTSL 426.22■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 LPAR2-204ENST00000588233 558 ntTSL 326.21■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-215ENST00000509068 805 ntTSL 325.8■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-208ENST00000474414 978 ntTSL 525.6■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 325.09■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 424.85■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 323.74■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 223.72■■□□□ 1.392e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 223.22■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 222.56■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 522.53■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.19■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)21.53■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.5■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 321.26■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-213ENST00000530753 571 ntTSL 420.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-214ENST00000530876 570 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 319.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-202ENST00000373520 1630 ntTSL 219.09■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 318.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 518.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 SLC12A7-204ENST00000513223 1066 ntTSL 518.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 318.15■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-215ENST00000531222 562 ntTSL 317.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-210ENST00000527163 567 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-211ENST00000527513 576 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 OSBPL5-216ENST00000533721 774 ntTSL 416.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.33■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 516.1■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-216ENST00000497909 773 ntTSL 315.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.8■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt15.52■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.46■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 515.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-212ENST00000530485 482 ntTSL 515.2■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 315.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-216ENST00000533084 564 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 414.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-217ENST00000498670 791 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 37.3
DDX52Q9Y2R4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 37.3
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