Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
R3HDM2Q9Y2K5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
R3HDM2Q9Y2K5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
R3HDM2Q9Y2K5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
R3HDM2Q9Y2K5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
R3HDM2Q9Y2K5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HDM2Q9Y2K5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HDM2Q9Y2K5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HDM2Q9Y2K5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM2Q9Y2K5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM2Q9Y2K5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM2Q9Y2K5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM2Q9Y2K5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM2Q9Y2K5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HDM2Q9Y2K5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM2Q9Y2K5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM2Q9Y2K5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HDM2Q9Y2K5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM2Q9Y2K5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HDM2Q9Y2K5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms