Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms