Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERGIC3Q9Y282 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERGIC3Q9Y282 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERGIC3Q9Y282 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERGIC3Q9Y282 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERGIC3Q9Y282 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERGIC3Q9Y282 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERGIC3Q9Y282 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms