Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1a4Q9WV27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1a4Q9WV27 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1a4Q9WV27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1a4Q9WV27 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1a4Q9WV27 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Atp1a4Q9WV27 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1a4Q9WV27 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1a4Q9WV27 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms